Genetic divergence among special rice types trought of multivariate techniques

Authors

  • Rafael Hydalgo Passeri-lima Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Campos dos Goytacazes, RJ, Brasil.
  • Luiz Beja Moreira Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, Brasil.
  • Higino Marcos Lopes Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, Brasil.
  • Maurício Ballesteiro Pereira Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, Brasil.
  • Bruna Rafaela da Silva Menezes Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, Brasil.
  • Diogo de Vilela Marinho Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, Brasil.

DOI:

https://doi.org/10.5965/223811711932020299

Keywords:

red rice, yield, genetic variability

Abstract

The brazilian rice market prioritizes the consumption of polished white rice. However, there are demands for special types. The estimation of genetic divergence is important for genetic improvement, as it allows the selection of parents in controlled crossbreeding systems. Thus, the objectives of this work were to indicate the relative contribution of the evaluated traits to the genetic dissimilarity and to evaluate the genetic divergence among genotypes of special types of rice by two different methods of grouping. The experiment was carried out from October 2012 to March 2013, at the UFRRJ, Seropédica, RJ. The design used was in randomized blocks, with five replications. The treatments consisted of the genotypes Caiapó, Vermelho Pequeno, IAC 300, IAC 400 and IAC 500. The measure of dissimilarity adopted was the Euclidean distance. Two different optimization methods were used: the Tocher optimization method and the UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Averages) hierarchical method. The genotypes Caiapó and Vermelho Pequeno were in different heterotic groups in relation to the genotypes IAC 300 and IAC 400, using the clustering method used. It was found that the yield trait was the one that most influenced the total variation.

Downloads

Download data is not yet available.

References

ALJUMAILI SJ et al. 2018. Genetic diversity of aromatic rice germplasm revealed by SSR markers. BioMed Research International 2018: ID 7658032.

ANGGRAINI T et al. 2015. Antioxidant activities of some red, black and white rice cultivar from West Sumatra, Indonesia. Pakistan Journal of Nutrition 14: 112-117.

AZEVEDO AM et al. 2013. Seleção de genótipos de alface para cultivo protegido: divergência genética e importância de caracteres. Horticultura Brasileira 31: 260-265.

BOHRY D et al. 2019. Characterization and genetic divergence of araçá-boi based on physicochemical and colorimetric traits of fruits. Revista de Ciências Agrárias 62: rca.2019.3004.

COIMBRA RR et al. 2010. Caracterização e divergência genética de populações de milho resgatadas do Sudeste de Minas Gerais. Revista Ciência Agronômica 41: 159-166.

CRUZ CD et al. 2014. Modelos biométricos aplicados ao melhoramento genético. Viçosa: UFV. 668p.

DALCHIAVON FC et al. 2012. Correlação linear entre componentes da produção e produtividade do arroz de terras altas em sistema de plantio direto. Semina: Ciências Agrárias 33: 1629-1642.

EMBRAPA. 2006. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária. Sistema Brasileiro de Classificação de Solos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos. 306p.

GONÇALVES DL et al. 2014. Divergência genética de acessos tradicionais de feijoeiros através de características da semente. Bioscience Journal 30: 1671-1681.

HALLAUER AR & MIRANDA JB. 1988. Germplasm. In: HALLAUER AR & MIRANDA JB. (2.ed.). Quantitative genetics in maize breeding. Ames: Iowa State University Press. p.375-396.

HAIR JF et al. 2009. Análise multivariada de dados. 6.ed. Porto Alegre: Editora Bookman. 688p.

MELO AV et al. 2019. Divergência genética entre híbridos de milho em condições de deficiência hídrica. Revista de Agricultura Neotropical 6: 66-75.

MENEZES BRS et al. 2011. Caracterização morfoagronômica em arroz vermelho e arroz de sequeiro. Pesquisa Agropecuária Tropical 41: 490-499.

MENEZES BRS et al. 2013. Avaliação da germinação e dormência de sementes de arroz vermelho e branco. Revista de Ciências Agroveterinárias 12: 129-140.

NASS LL et al. 1992. Utilization of genetic resources for maize and syubean breeding in Brazil. Brazilian Journal of Genetics 16: 983-988.

OLIVEIRA ACR et al. 2019a. Genetic divergence between pepper accessions based on quantitative fruit traits. Científica 47: 83-90.

OLIVEIRA CS de et al. 2019b. Características de plântulas: dissimilaridade genética entre acessos de pimenta. Ciência, Tecnologia & Ambiente 9: e09114.

PAIVA ALC et al. 2010. Análise de componentes principais em características de produção de aves de postura. Revista Brasileira de Zootecnia 39: 285-288.

R DEVELOPMENT CORE TEAM. 2006. A language and environment for statistical computing. Vienna: R Foundation for Statistical Computing. Disponível em http://www.r-project.org/. Acesso em: 30 jun. 2013.

ROCHA G et al. 2020. Características morfoagronômicas na colheita principal e na soca e análise de trilha em tipos especiais de arroz. Cultura Agronômica 29: 38-49.

VEIGA RFA et al. 2012. Bancos de germoplasma: importância e organização. In: COSTA AM et al. (Ed.). Conservação de recursos genéticos no Brasil. Brasília: Embrapa. p.104-105.

VIDAL AKF et al. 2018. Estimative of genetic diversity in germ-plasm of elephant grass using the Gower algorithm. Genetics and Molecular Research 17: gmr16039934.

Published

2020-09-30

How to Cite

PASSERI-LIMA, Rafael Hydalgo; MOREIRA, Luiz Beja; LOPES, Higino Marcos; PEREIRA, Maurício Ballesteiro; MENEZES, Bruna Rafaela da Silva; MARINHO, Diogo de Vilela. Genetic divergence among special rice types trought of multivariate techniques. Revista de Ciências Agroveterinárias, Lages, v. 19, n. 3, p. 299–304, 2020. DOI: 10.5965/223811711932020299. Disponível em: https://www.revistas.udesc.br/index.php/agroveterinaria/article/view/15168. Acesso em: 15 may. 2024.

Issue

Section

Research Article - Science of Plants and Derived Products

Most read articles by the same author(s)